En lo que respecta a los puestos de la pelea por el campeonato, Charles Leclerc se quedó con el mejor tiempo en la segunda práctica libre. Al volante de su Ferrari, el piloto monegasco giró en 1m37s528 para encabezar una tanda disputada sobre pista seca, a pesar de las constantes amenazas de lluvia en el circuito de Sepang.
El novato Isack Hadjar sorprendió al ubicar su Red Bull en la segunda posición a solo 0s099 de la cima, mientras que Lando Norris completó el podio virtual con McLaren a 0s137. Por su parte, Max Verstappen, líder de la FP1, finalizó cuarto; no obstante, el neerlandés marcó su registro con neumáticos medios, a diferencia de sus rivales directos que giraron con el compuesto blando.
El top 10 lo completaron Lewis Hamilton (5°), Oscar Piastri (6°), George Russell (8°), Kimi Antonelli (9°) y Pierre Gasly (10°) con el primer Alpine. La actividad de la FP2 concluyó bajo régimen de Virtual Safety Car debido a la detención en pista del Audi de Gabriel Bortoleto, lo que precipitó el cierre de las simulaciones de carrera previa al domingo.